More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4313 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  100 
 
 		 170 aa  348  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  98.17 
 
 		 165 aa  330  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  96.95 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  95.12 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  95.12 
 
 		 165 aa  321  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  95.12 
 
 		 165 aa  321  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  94.51 
 
 		 165 aa  320  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  94.51 
 
 		 165 aa  320  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  93.29 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  94.19 
 
 		 156 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  75 
 
 		 165 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  39.75 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.63 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  37.89 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  41.77 
 
 		 209 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  42.5 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  42.5 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  41.77 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  42.5 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  41.77 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  42.5 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  42.5 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  39.24 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  33.54 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  38.93 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  39.07 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  39.24 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.33 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  38.27 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  34.52 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  38.61 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  39.24 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  39.24 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  38.41 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  36.65 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.93 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  34.76 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  37.95 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  38.41 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  37.65 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  36.42 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  36.42 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.8 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  37.11 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  34.15 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  34.15 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  37.34 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  34.73 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  37.65 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  36.88 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  40.4 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  34.13 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  38.04 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  37.27 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  40.4 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  37.42 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  37.87 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  36.21 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  40.4 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.92 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  38.78 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  35.88 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  35.15 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  37.13 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  36.2 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  36.59 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  35.19 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  35.33 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  37.27 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  34.81 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  34.71 
 
 		 199 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  37.13 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  34.52 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  35.59 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.76 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  36.75 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  34.32 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  35.98 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.67 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  35.12 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  34.39 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  34.91 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  34.15 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  34.52 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  38.24 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.13 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  36.26 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  35.58 
 
 		 219 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  35.37 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  40.67 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  35.95 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  36.42 
 
 		 264 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  31.9 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  34.94 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  34.12 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  36.9 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.76 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  34.12 
 
 		 579 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  33.95 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>