More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2014 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  100 
 
 		 169 aa  337  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  56.88 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  51.53 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  45.06 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  44.72 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  44.94 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  46.2 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  46.41 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  45.1 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12700  shikimate kinase  46.01 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.947256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  48.75 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  42.86 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  44.3 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  44.72 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  47.5 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  40.72 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  40.49 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  39.75 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  36.59 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  45.27 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  37.18 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  37.5 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  41.38 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  40.41 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  42 
 
 		 220 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  34.38 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  38.65 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  39.16 
 
 		 196 aa  97.4  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  40.67 
 
 		 235 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  40.67 
 
 		 235 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  40.67 
 
 		 235 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  39.02 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  40 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  41.67 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  40.67 
 
 		 220 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  34.73 
 
 		 199 aa  94  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  36.53 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  36.53 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  34.13 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.21 
 
 		 593 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  36.42 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  36.97 
 
 		 519 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  34.13 
 
 		 197 aa  90.9  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  36.69 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  36.9 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  33.53 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  34.73 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  35.26 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  39.13 
 
 		 196 aa  87.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  39.75 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  34.57 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  31.72 
 
 		 462 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  35.33 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  37.06 
 
 		 577 aa  86.3  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  37.2 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  30.95 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  34.23 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  37.67 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  34.5 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  30.63 
 
 		 454 aa  84.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  33.53 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  34.73 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  36.69 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  34.73 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  34.73 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  28.31 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  43.4 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  36.49 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  33.73 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  34.23 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  35.95 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  31.48 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.34 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  32.92 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  32.92 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  36.88 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  36.49 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  33.53 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  36.6 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  36.49 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  31.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  31.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  33.13 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  32.12 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  35.37 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  31.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  31.74 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  35.57 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  32.73 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  30.12 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  37.75 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  34.13 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  34 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  34 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>