More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0694 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0694  shikimate kinase  100 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00295001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  98.2 
 
 		 167 aa  330  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  39.39 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  42.14 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  33.14 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  38.46 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  36.02 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  35.09 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  32.94 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 495 aa  91.3  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  36.05 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  31.37 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  38.41 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  31.36 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  35.98 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  40.67 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  32.73 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  35.17 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  35.47 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  35 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0587  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 492 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.09 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  36.2 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  30.72 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  34.94 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  36.31 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  39.31 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  39.31 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  33.53 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  34.81 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  35.58 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  36.2 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  33.12 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0280  Shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  36.6 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.71 
 
 		 179 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  39.31 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  37.93 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  35.12 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  32.52 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  30.77 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  34.62 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  33.33 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  35.76 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  30.72 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  34.9 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  33.77 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  35.58 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  34.86 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  34.76 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  35.86 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  35.86 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  37.93 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  35.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  35.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  35.86 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  35.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  35.53 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  35.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  35.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  34.72 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  39.86 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  39.86 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  30.82 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  33.74 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  39.86 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  33.74 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  33.74 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  33.74 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  35.29 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  33.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  33.74 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  30.36 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  36.73 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  36.11 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  37.89 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  37.89 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  33.81 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  33.81 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  38.69 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  37.24 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  32.94 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  37.58 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  31.91 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  31.29 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  36.77 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  33.54 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  35 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2880  shikimate kinase  34.3 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  35.58 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.8 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  32.92 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  34.16 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  33.54 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  31.71 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  34.15 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  32.12 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  41.12 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>