More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1855 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  70.72 
 
 
181 aa  271  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  56.5 
 
 
184 aa  228  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  53.18 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  53.18 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  54.1 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  52.33 
 
 
190 aa  191  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  51.41 
 
 
199 aa  180  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  48.55 
 
 
191 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  49.08 
 
 
169 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  46.55 
 
 
192 aa  160  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  46.47 
 
 
185 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  45.61 
 
 
185 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  45.96 
 
 
277 aa  151  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  44.51 
 
 
197 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  45.35 
 
 
185 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  45.35 
 
 
185 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  41.86 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  41.14 
 
 
198 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  44.1 
 
 
172 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  42.68 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  43.9 
 
 
178 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  45.27 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  39.64 
 
 
171 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  43.83 
 
 
175 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  41.07 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  43.11 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  41.76 
 
 
173 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  43.51 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  40.46 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  41.9 
 
 
192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  43.21 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  42.42 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  39.88 
 
 
185 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  41.36 
 
 
169 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  39.88 
 
 
181 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  40.12 
 
 
193 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  39.33 
 
 
182 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  39.49 
 
 
168 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  41.4 
 
 
195 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  37.2 
 
 
186 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  36.59 
 
 
186 aa  120  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  40.49 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  38.41 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  43.86 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  42.42 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  37.35 
 
 
166 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  40.85 
 
 
179 aa  118  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  40.22 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  40.61 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  39.38 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  39.63 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.29 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.29 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  39.63 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  39.51 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  41.83 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  37.87 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  38.37 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  40.37 
 
 
180 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  40 
 
 
176 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  39.39 
 
 
172 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  39.39 
 
 
172 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  39.41 
 
 
172 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  40.94 
 
 
172 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  38.51 
 
 
229 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  40 
 
 
172 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  38.1 
 
 
199 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  37.8 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  43.84 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  38.41 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  38.41 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  39.39 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  42.86 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  41.55 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 
604 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.2 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  37.8 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  37.8 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  36.75 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  39.76 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  39.88 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  40.37 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  38.41 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  40.91 
 
 
167 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  37.2 
 
 
200 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  39.77 
 
 
172 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  44.06 
 
 
196 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  38.22 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  39.26 
 
 
165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  40.91 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  41.55 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  42.18 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  38.46 
 
 
197 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  40.12 
 
 
180 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  39.02 
 
 
165 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  39.87 
 
 
172 aa  111  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  35.37 
 
 
192 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>