More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1556 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  100 
 
 		 173 aa  343  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  45.29 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  44.38 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  43.11 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  41.76 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  49.06 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  47.3 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  41.76 
 
 		 181 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.02 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  42.95 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  44.65 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  43.56 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  39.53 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  40.61 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  41.51 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  48.45 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  41.88 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  44.79 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  41.42 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  42.17 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  45.51 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  44.79 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  42.94 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  41.76 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  42.26 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  40.72 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 593 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  45.18 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  38.95 
 
 		 199 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  41.21 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  42.86 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  41.14 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  39.78 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  42.14 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  42.5 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  41.77 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  39.26 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  40.51 
 
 		 454 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  37.72 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  45.51 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  40.12 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  35 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  40 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  34.73 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  42.5 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  39.26 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  40 
 
 		 216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  36.42 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  36.53 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  39.26 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  39.74 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  39.88 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  39.87 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  35.23 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  37.79 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  38.6 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  42 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  36.75 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.42 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.42 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  41.07 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.21 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  35.5 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.97 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  34.46 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  42.77 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  37.04 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  46.21 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  38.46 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  37.04 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 551 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  39.63 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  41.92 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  41.78 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  45.68 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  35.8 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  37.08 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  42.57 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  40 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  44.38 
 
 		 458 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  38.18 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  43.04 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  39.41 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  40.62 
 
 		 229 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  38.18 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  40 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 519 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  36.97 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  43.37 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  36.81 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  38.79 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.19 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  40.85 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  40 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  37.5 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  42.05 
 
 		 277 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  39.47 
 
 		 199 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 577 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  47.62 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  41.98 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>