More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1476 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  97.98 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  56.99 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  50.27 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  49.21 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  48.91 
 
 		 192 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  47.83 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  50.88 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  49.43 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  48.85 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  42.94 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  41.28 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  40.66 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  40.66 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  41.14 
 
 		 181 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  39.43 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  38.62 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  41.92 
 
 		 169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  37.99 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  38.61 
 
 		 166 aa  118  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  40.96 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  40.96 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  38.32 
 
 		 174 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  38.92 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  37.87 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  38.85 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  39.43 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  36.14 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  40.12 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  35.12 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  35.12 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  37.87 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  35.37 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  34.52 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  37.87 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  37.72 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  37.87 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  37.87 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  41.13 
 
 		 170 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.71 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  37.02 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  37.02 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  37.02 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  37.95 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  37.87 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  37.87 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  35.71 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  37.35 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.58 
 
 		 167 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  35.76 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  35.71 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  40.54 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  37.95 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  36.97 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  33.52 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  34.01 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  36.53 
 
 		 172 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  35.06 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  37.35 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  36.42 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  35.06 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  35.06 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  35.06 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  35.06 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  37.01 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  35.06 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  35.06 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  36.75 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  36.75 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.12 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  38.6 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  35.63 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  33.33 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  37.01 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.75 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  33.89 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  36.42 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>