More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0912 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  100 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  40.12 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  41.46 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  41.32 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  43.12 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  45.06 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  36.71 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  40 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  40.52 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  42.5 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  42.58 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  39.88 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12700  shikimate kinase  39.77 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.947256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  45.27 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  38.26 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  43.79 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  37.5 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  41.07 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  39.51 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  32.34 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  36.88 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  37.5 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  41.89 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  42.17 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  32.72 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  40.49 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  34.12 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  35.5 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  43.14 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  38.51 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  38.27 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  34.12 
 
 		 225 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  34.12 
 
 		 225 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  34.12 
 
 		 225 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  34.15 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.95 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.05 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  32.75 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  41.43 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  31.37 
 
 		 167 aa  90.9  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0694  shikimate kinase  31.37 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00295001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  34.76 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  35.76 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  32.73 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  39.04 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  32.1 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  37.18 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  32.53 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  35.76 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  35.77 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.39 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  36.42 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  31.48 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 591 aa  88.2  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  32.56 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  36.75 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  28.05 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  32.12 
 
 		 186 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.93 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 551 aa  87.4  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  35.19 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  33.95 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  37.24 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  38.03 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  38.51 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  32.75 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  35.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0660  shikimate kinase  31.33 
 
 		 436 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.737166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  38.06 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  42.86 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  36.2 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  37.8 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  37.32 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  32.75 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  35.8 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  37.2 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  36.53 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  38.36 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  32.16 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>