More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1850 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  67.92 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  61.25 
 
 		 166 aa  206  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  54.22 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  56.05 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  49.69 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  47.13 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  43.37 
 
 		 171 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  46.63 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  44.44 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  46.2 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12700  shikimate kinase  43.48 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.947256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  41.77 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  41.14 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  39.87 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  42.5 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  37.5 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  39.05 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  37.82 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  39.64 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  39.88 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  39.16 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  38.51 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  38.51 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  38.51 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  40.62 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  40.85 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  37.34 
 
 		 196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  38.99 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  36.09 
 
 		 220 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  35.15 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  36.81 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  36.81 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  34.13 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  33.73 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.73 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  33.53 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  32.93 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  34.73 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  34.73 
 
 		 206 aa  95.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  32.34 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.15 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  35.62 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  33.33 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  31.1 
 
 		 184 aa  94.4  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  35.33 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  32.73 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  32.08 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  31.93 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  32.93 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  33.33 
 
 		 169 aa  91.3  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  32.47 
 
 		 190 aa  90.9  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  35.22 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  33.93 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  32.93 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  35.88 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  33.54 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  31.29 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  30.57 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  38.69 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  34.73 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  30.67 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  31.14 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  31.71 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  31.71 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  34.12 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  31.36 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  31.71 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  39.04 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  31.41 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  32.1 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  39.04 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  32.53 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  31.71 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  29.48 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  32.08 
 
 		 519 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  32 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  31.06 
 
 		 462 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  31.1 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  30.86 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 225 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  30.86 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  28.74 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>