More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3142 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 519 aa  1026    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  53.32 
 
 		 577 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  61.25 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  58.47 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  57.06 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  58.06 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  55.4 
 
 		 358 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 370 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  54.75 
 
 		 363 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  54.26 
 
 		 358 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 358 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 593 aa  350  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  51.09 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 		 371 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  52.54 
 
 		 368 aa  346  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  54.47 
 
 		 363 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 371 aa  340  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  51.97 
 
 		 365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  56.73 
 
 		 366 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  54.6 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  52.26 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  53.12 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  51.55 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  53.5 
 
 		 361 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 371 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  51.69 
 
 		 359 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  51.82 
 
 		 389 aa  319  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  52.86 
 
 		 360 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  52.86 
 
 		 360 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  52.86 
 
 		 360 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  52.37 
 
 		 353 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  48.04 
 
 		 360 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 539 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 591 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.54 
 
 		 593 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.66 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  38.45 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  46.25 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  36.89 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  47.87 
 
 		 370 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 372 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 370 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  34.65 
 
 		 368 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 		 373 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 370 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  34.08 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 370 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 367 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  39.73 
 
 		 369 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 359 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 368 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 366 aa  217  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 369 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 370 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  34.46 
 
 		 351 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  44.66 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.85 
 
 		 361 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.93 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  34.46 
 
 		 351 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  39.21 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 367 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 356 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 363 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 368 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  35.46 
 
 		 364 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 376 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 368 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.23 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 		 374 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  33.85 
 
 		 351 aa  210  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 361 aa  209  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 368 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 370 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  39.06 
 
 		 358 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>