More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3757 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  88.18 
 
 		 220 aa  347  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  70.61 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  70.61 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  70.61 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  82.25 
 
 		 176 aa  279  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  54.69 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  53.94 
 
 		 180 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  51.53 
 
 		 171 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  50 
 
 		 172 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  52.44 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  50 
 
 		 167 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  47.59 
 
 		 165 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  46.95 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  46.71 
 
 		 183 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  50.64 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  48.78 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  47.59 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  43.71 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  45.24 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  47.27 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  44.05 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  46.95 
 
 		 519 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 577 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  41.95 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  47.4 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1839  shikimate kinase  48.39 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3152  Shikimate kinase  44.65 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1700  shikimate kinase  43.9 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1846  shikimate kinase  48.19 
 
 		 167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3208  shikimate kinase  46.79 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  39.64 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  43.11 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  46.54 
 
 		 163 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  42.59 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  42.59 
 
 		 172 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  39.1 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  39.1 
 
 		 180 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  41.67 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  43.03 
 
 		 184 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  42.77 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  41.98 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  48.53 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  38.99 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  39.51 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  43.83 
 
 		 172 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  43.83 
 
 		 172 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  39.39 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  41.52 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  42.59 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  42.59 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  43.21 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  41.1 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  36.14 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  40.61 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  39.41 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  41.25 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  33.53 
 
 		 181 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  36.59 
 
 		 174 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  38.92 
 
 		 170 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  42.77 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  39.39 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  41.92 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  42.07 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  42.07 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  38.01 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  37.34 
 
 		 540 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  38.33 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  38.82 
 
 		 174 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  40.99 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  41.14 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  42.04 
 
 		 161 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 		 454 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  43.05 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  38.51 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 560 aa  101  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  39.77 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  40 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  38.46 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  39.05 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  38.92 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  44.93 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  42.41 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  39.16 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  39.64 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  38.46 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  37.65 
 
 		 175 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>