More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3524 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  56.1 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  55.76 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  52.12 
 
 		 181 aa  180  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  50.62 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  50.62 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  49.08 
 
 		 181 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  52.76 
 
 		 191 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  51.53 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  44.05 
 
 		 184 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  47.02 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  43.21 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  41.92 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  42.51 
 
 		 277 aa  132  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  41.98 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  42.24 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  46.67 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  40 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  42.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  41.14 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  46.58 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  40.51 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  38.99 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  42.94 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  39.87 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  45.96 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  45.96 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  40 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  39.35 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  43.23 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  39.1 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  40 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  41.33 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  42.01 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 591 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  43.57 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  41.73 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  43.4 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  44.36 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  43.12 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  39.31 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  41.77 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  41.61 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  37.97 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  41.79 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  44.7 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  43.94 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 519 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  41.88 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  36.23 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  41.77 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 593 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  37.35 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  39.44 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  44.7 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.29 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.29 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  39.58 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  39.87 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  37.82 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  41.04 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  37.25 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  39.24 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  37.5 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  38.31 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  35.26 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  35.63 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  35.26 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  37.34 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  41.98 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  35.14 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  43.38 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  38.24 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  38.03 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 615 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  40.74 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  42.86 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  39.24 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  37.41 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  40.74 
 
 		 209 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  40.74 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  42.22 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  40.74 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  40.74 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  40.74 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  33.89 
 
 		 264 aa  99  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  40.74 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  36.14 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  37.2 
 
 		 199 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  40.74 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  33.97 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  36.31 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  41.13 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  38.61 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  41.77 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  37.01 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  41.43 
 
 		 169 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  37.58 
 
 		 176 aa  97.8  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  34.81 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>