More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1516 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  75.94 
 
 		 199 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  62.44 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  64.29 
 
 		 190 aa  244  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  63.74 
 
 		 202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  63.89 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  64.44 
 
 		 190 aa  234  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  41.81 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  39.88 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.53 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  35.48 
 
 		 178 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  38.46 
 
 		 181 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  36.26 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  35.29 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  37.06 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  37.06 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  36.13 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  36.97 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  41.77 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  35.29 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  35.88 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  35.88 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.47 
 
 		 165 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  35.58 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  32.78 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  40.24 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  37.28 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.88 
 
 		 165 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  35.67 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  34.09 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  35.88 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  35.88 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  35 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.33 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  37.72 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  33.53 
 
 		 170 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  32.78 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  37.64 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  33.71 
 
 		 593 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  31.43 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  32.77 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  35.43 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  35.43 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  34.66 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36.13 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.59 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  37.21 
 
 		 174 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.11 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  37.18 
 
 		 170 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  35.09 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  34.57 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.05 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  36.84 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  33.13 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  33.13 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  33.15 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  32.75 
 
 		 175 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  36.36 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  39.22 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  36.52 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  38.4 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  35.58 
 
 		 156 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  39.87 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.34 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  34.19 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  32.24 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  31.79 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  34.42 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  36.13 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  34.88 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  32.47 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  34.09 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 		 539 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  35.47 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  34.87 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  31.76 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  35.93 
 
 		 277 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  31.79 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0198  Shikimate kinase  33.53 
 
 		 162 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  34.59 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  31.76 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  34.09 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  36.71 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.63 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0209  Shikimate kinase  33.53 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  33.14 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  32.2 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  34.38 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  33.33 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  32.47 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 615 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  31.94 
 
 		 579 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  35.03 
 
 		 171 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  32.24 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28 
 
 		 342 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  32.77 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  32.77 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  33.33 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>