More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0837 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  69.78 
 
 		 199 aa  259  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  66.67 
 
 		 264 aa  255  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  64.52 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  65.93 
 
 		 202 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  64.29 
 
 		 197 aa  244  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  67.22 
 
 		 190 aa  238  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  41.38 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.53 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  37.08 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  37.36 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  38.67 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  37.14 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  36.52 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  35.2 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  37.22 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  36.13 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  34.27 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  39.61 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  35.29 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  37.43 
 
 		 181 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.24 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  34.66 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  35.63 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  34.22 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  37.25 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  37.13 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  36.26 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  36.26 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  36.18 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  35.67 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  35.96 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 539 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  35.67 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  32.42 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  32.95 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  31.84 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  32.78 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.13 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  37.42 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  31.18 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  33.7 
 
 		 170 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 593 aa  98.2  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  34.44 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  34.46 
 
 		 178 aa  97.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  34.64 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  31.28 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  33.33 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  31.18 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  34.94 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  37.97 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  34.5 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  31.18 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  34.32 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  32.75 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  34.66 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  37.5 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  33.71 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  31.11 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  34.27 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.43 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.48 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  32.75 
 
 		 170 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  37.02 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  35.88 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  35.11 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  35.67 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  34.3 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  33.52 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  34.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.17 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  38.84 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  35.29 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  37.34 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  32.47 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  36.18 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  32.39 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  34.84 
 
 		 277 aa  91.7  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  30.22 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  35.29 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  34.91 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  36.18 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  37.43 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  34.44 
 
 		 168 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  36.53 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  34.76 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  30.9 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  32.3 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  33.12 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  34.97 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  35.5 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  32.58 
 
 		 552 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  33.77 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  34.97 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>