More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0266 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 539 aa  1085    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  54.94 
 
 		 352 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  51.62 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  46.53 
 
 		 364 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  48.54 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 385 aa  316  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  45.09 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 		 593 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 604 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 579 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.46 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 368 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.24 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 368 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 363 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  37.55 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 368 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  47.69 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  48.2 
 
 		 362 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  36.53 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 377 aa  266  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 371 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 370 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 370 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.34 
 
 		 368 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 368 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 356 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 362 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 368 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  44.97 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  36.14 
 
 		 551 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 359 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 374 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  36.61 
 
 		 363 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  43.03 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  42.39 
 
 		 370 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 370 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 355 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  40.25 
 
 		 358 aa  247  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 358 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 373 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  41.38 
 
 		 358 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  46.77 
 
 		 370 aa  246  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.1 
 
 		 366 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  45.23 
 
 		 370 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 358 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 360 aa  244  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 368 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  44.1 
 
 		 383 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 366 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 370 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 356 aa  243  7e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  32.5 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  39.16 
 
 		 359 aa  242  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.37 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 359 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 359 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>