More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1202 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  720    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  47.99 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  48.55 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  47.86 
 
 		 368 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.99 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  44 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  47.97 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.93 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  48.05 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  48.57 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.63 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  45.11 
 
 		 368 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  47.98 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  48.26 
 
 		 372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  44.96 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 364 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.97 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 376 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  44 
 
 		 376 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  42.43 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 367 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 		 591 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.62 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.13 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  48.67 
 
 		 352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.72 
 
 		 431 aa  266  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  48.53 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  48.99 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  43.86 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.35 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  48.68 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  46.92 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  46.92 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.94 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 367 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  262  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 358 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 358 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  44.97 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>