More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0125 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  740    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  99.44 
 
 		 360 aa  733    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  53.37 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  51.4 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  51.42 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  50.99 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  52.17 
 
 		 368 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  52.17 
 
 		 368 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  52.05 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  52.82 
 
 		 359 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  50.99 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 365 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 367 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  52.31 
 
 		 362 aa  345  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 362 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  50.86 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  48.18 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  48.59 
 
 		 369 aa  332  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  47.35 
 
 		 368 aa  332  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  47.03 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 374 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 358 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 368 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  48.13 
 
 		 359 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 368 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 359 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  48.43 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  47.63 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  47.66 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 		 359 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  47.62 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  49.43 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 370 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>