More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3129 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  88.86 
 
 		 368 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  82.07 
 
 		 368 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  80.98 
 
 		 368 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  80.43 
 
 		 368 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  73.46 
 
 		 361 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  73.46 
 
 		 361 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  72.91 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  72.75 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  73.16 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  73.03 
 
 		 359 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  72.47 
 
 		 359 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  72.75 
 
 		 359 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  72.47 
 
 		 359 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  72.19 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  72.75 
 
 		 359 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  63.94 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  62.99 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  65.29 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  64.97 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  64.33 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  63.46 
 
 		 370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  62.25 
 
 		 372 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  62.04 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  62.08 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  61.97 
 
 		 376 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  62.5 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  60.56 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  61.8 
 
 		 373 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  60.56 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  61.06 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  62.25 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  59.35 
 
 		 365 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  59.35 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  59.35 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  58.94 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  63.16 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  59.55 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  60.34 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  59.22 
 
 		 362 aa  414  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  59.66 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  59.32 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  58.71 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  58.71 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  59.54 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  57.23 
 
 		 366 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  55.9 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  54.97 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  57.69 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  55.34 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  56.89 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  56.89 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  54.59 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  54.42 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  56.6 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  56.05 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  53.09 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  56.52 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  55.83 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  55 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  57.26 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  53.96 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  55.12 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  55.56 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  52.48 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  52.78 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  53.06 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  53.08 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  52.68 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  50.41 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  53.5 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  52.29 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  51.3 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  53.67 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  54.04 
 
 		 357 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  51.4 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>