More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0995 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 369 aa  759    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  98.64 
 
 		 369 aa  751    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  49 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  48.22 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.71 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  48.59 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 359 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.42 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.42 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.61 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 358 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.14 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  47.03 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  46.57 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  47.03 
 
 		 358 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  48.86 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 		 359 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.43 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 373 aa  319  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 364 aa  318  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  48.72 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  47.28 
 
 		 367 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 368 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.13 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  45.61 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  47.43 
 
 		 367 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  49.28 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  47.56 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 		 355 aa  305  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 431 aa  305  8.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  42.58 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 350 aa  303  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.01 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  46.47 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  45.27 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  45.95 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  46.84 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  45.69 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>