More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03241 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 362 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  99.72 
 
 		 362 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  92.82 
 
 		 362 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  736    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  92.82 
 
 		 362 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  92.82 
 
 		 362 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  92.82 
 
 		 362 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  99.45 
 
 		 362 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  99.45 
 
 		 362 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  99.72 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 362 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  99.45 
 
 		 362 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  89.78 
 
 		 362 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  99.17 
 
 		 362 aa  731    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  93.09 
 
 		 362 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  82.17 
 
 		 366 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  81.44 
 
 		 361 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  78.83 
 
 		 361 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  81.44 
 
 		 362 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  81.44 
 
 		 362 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  81.44 
 
 		 362 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  80.22 
 
 		 361 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  81.34 
 
 		 361 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  61.22 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  60.56 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  61.28 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  63.51 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  60.61 
 
 		 356 aa  454  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  60.61 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  61.85 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  61 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  61 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  61 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  61.56 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  60.72 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  61.71 
 
 		 350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  60.96 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  60.96 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  59.38 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  59.55 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  60.17 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  58.26 
 
 		 358 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  58.71 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  61.81 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2723  3-dehydroquinate synthase  59.62 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  59.66 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  58.81 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  59.09 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  58.24 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  59.18 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  56.53 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  56.56 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 		 367 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  58.81 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  57.87 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  58.24 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  56.18 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  58.55 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  56.82 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  58.5 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  56.57 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  57.06 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  57.94 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  58.5 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  58.98 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  54.42 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  56.63 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  58.31 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  53.04 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  57.39 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  57.78 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  60.8 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  57.78 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  52.88 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  58.08 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  58.08 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  53.33 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  53.2 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 		 367 aa  374  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  55.56 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  54.14 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>