More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3802 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  89.78 
 
 
362 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  90.06 
 
 
362 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  89.78 
 
 
362 aa  654    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
362 aa  739    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  88.67 
 
 
362 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  90.06 
 
 
362 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  88.67 
 
 
362 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  89.78 
 
 
362 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  88.67 
 
 
362 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  88.67 
 
 
362 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  88.67 
 
 
362 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  90.06 
 
 
362 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  90.06 
 
 
362 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  89.23 
 
 
362 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  89.78 
 
 
362 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  83.29 
 
 
366 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  79.67 
 
 
361 aa  604  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  82.17 
 
 
361 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  82.27 
 
 
362 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  82.27 
 
 
362 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  82.27 
 
 
362 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  80.22 
 
 
361 aa  587  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  80.56 
 
 
361 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  62.5 
 
 
366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  63.89 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  62.5 
 
 
359 aa  465  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  62.78 
 
 
366 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  62.97 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  61.78 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  62.36 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  64.14 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  61.49 
 
 
359 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  62.97 
 
 
358 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  63.27 
 
 
358 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  63.27 
 
 
358 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  63.27 
 
 
358 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  62.57 
 
 
359 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  62.29 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  60.5 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  60.72 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  61.8 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 
359 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  59.22 
 
 
362 aa  435  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  58.26 
 
 
358 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  57.58 
 
 
356 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  62.39 
 
 
361 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  58.79 
 
 
357 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2723  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 
367 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  60.23 
 
 
359 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  56.53 
 
 
354 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 
368 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 
358 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 
367 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 
362 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  58.31 
 
 
355 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 
365 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 
367 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  58.81 
 
 
366 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 
368 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  55.25 
 
 
368 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  57.66 
 
 
372 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  57.85 
 
 
370 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  60.41 
 
 
359 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  58.06 
 
 
365 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 
374 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  54.42 
 
 
368 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  57.34 
 
 
370 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  55.25 
 
 
367 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 
367 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  56.79 
 
 
376 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  56.29 
 
 
368 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  53.44 
 
 
366 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  54.97 
 
 
367 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 
373 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  58.48 
 
 
364 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  55.14 
 
 
373 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  55.24 
 
 
363 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  57.19 
 
 
359 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  54.29 
 
 
359 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  55.28 
 
 
388 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  57.19 
 
 
359 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  55.43 
 
 
368 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  54.72 
 
 
372 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  50.99 
 
 
361 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
361 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
361 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  56.59 
 
 
359 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  54.24 
 
 
358 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>