More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0778 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 363 aa  736    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  47.24 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  47.24 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  45.25 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  48 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 363 aa  322  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  45.75 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  46.03 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 367 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.93 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 362 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  47.74 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  47.74 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  47.74 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  47.61 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.2 
 
 		 350 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  43.66 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 361 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.8 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  46.57 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0047  3-dehydroquinate synthase  48.74 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 388 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 360 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 367 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 365 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 359 aa  288  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  45.62 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>