More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0978 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 360 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  70.75 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  61.73 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  62.01 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  62.12 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  61.58 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  58.67 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  52.27 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  52.51 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  55.65 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  52.01 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  50.96 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  51.92 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  52.49 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  51.44 
 
 		 368 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  47.99 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  53.24 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  49.13 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  51.33 
 
 		 362 aa  328  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 366 aa  328  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  51.03 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  48.97 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  47.38 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  49.45 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  49.45 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  48.45 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  51.03 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  52.27 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  52.2 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  50.88 
 
 		 368 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  49.45 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  47.65 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  50.16 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  50.44 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 361 aa  318  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  50.89 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  45.17 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  49.12 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  53.96 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 359 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  48.85 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  51.76 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  51.78 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  48.53 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  49.1 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  48.85 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  47.98 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  48.85 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  48.85 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  47.65 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  52.06 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 		 370 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  48.84 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 359 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  51.52 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  52 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  47.19 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  47.62 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  47.99 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  50.88 
 
 		 368 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 358 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  51.18 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  50.88 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>