More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0659 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 360 aa  716    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  53.46 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  52.44 
 
 		 374 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  50.97 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  342  7e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  45.98 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  51.52 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  53.91 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0990  3-dehydroquinate synthase  56.29 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.661375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  46.54 
 
 		 358 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 363 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  50.87 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  47.63 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.61 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.61 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  50.97 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 367 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  46.37 
 
 		 366 aa  328  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  48.44 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  44.97 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  44.97 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  44.66 
 
 		 363 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  53.05 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.02 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.04 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  48.2 
 
 		 368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 373 aa  318  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  48.2 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>