More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1423 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
356 aa  717    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 
359 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 
363 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  45.79 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 
367 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 
360 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 
359 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 
364 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 
366 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  45.01 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  44.16 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 
359 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  44.05 
 
 
362 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 
366 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 
363 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
358 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 
359 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
358 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
358 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 
358 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
358 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
358 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 
368 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 
362 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 
372 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 
354 aa  296  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 
373 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 
359 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 
362 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 
364 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.66 
 
 
370 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 
364 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.68 
 
 
361 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 
367 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
356 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 
367 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 
368 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 
354 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 
368 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 
360 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 
361 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 
369 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
374 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 
431 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 
368 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
362 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
362 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
362 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
362 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
362 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
361 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 
370 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 
368 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  45.23 
 
 
366 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
355 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.12 
 
 
359 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 
360 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 
365 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 
361 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
368 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 
365 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.24 
 
 
366 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 
350 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 
367 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 
363 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 
358 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 
363 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 
362 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 
361 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>