More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1820 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 360 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  63.23 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  62.95 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  62.12 
 
 		 360 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  60.28 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  56.39 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  51.45 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  51.16 
 
 		 362 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  48.56 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 374 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  48.32 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  50.72 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  48.28 
 
 		 361 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 369 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  48.28 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  47.99 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  47.71 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  45.69 
 
 		 361 aa  319  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  47.69 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  48.18 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  45.06 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.12 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  47.38 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  47.38 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  47.13 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  47.13 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  49.27 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 365 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 376 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  48.86 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  47.24 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  51.23 
 
 		 364 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  47.65 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  49.7 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 		 368 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.12 
 
 		 368 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  48.56 
 
 		 359 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  46.97 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.66 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  47.63 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  48.13 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  45.29 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 370 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 358 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  47.97 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0990  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.661375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  45.72 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 364 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>