More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2027 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  61.54 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  58.67 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  56.69 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  51.76 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  52.39 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  54 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  50.84 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  46.57 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  46.75 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 361 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  50.73 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  48 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  49.28 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  51.78 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  47.75 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  51.6 
 
 		 376 aa  322  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  49.28 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  46.29 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  49.84 
 
 		 366 aa  319  6e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  47.32 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  47.43 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  47.43 
 
 		 350 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  50.87 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.75 
 
 		 365 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  47.88 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.38 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  45.95 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  47.59 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  47.59 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  47.59 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  48.59 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.2 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  49.27 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  45.98 
 
 		 361 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 364 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  46.97 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  47.26 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 		 368 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  48.16 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  45.79 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.79 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.79 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 358 aa  308  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  47.58 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  47.67 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>