More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1021 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  733    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  52.78 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  54.07 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  52.82 
 
 		 362 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 359 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  52.27 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  51.76 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 364 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  52.09 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  51.45 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  51.63 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 363 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  51.14 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 		 355 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 357 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  46.52 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  47.59 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  51.26 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  47.62 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  52.94 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0990  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.661375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  48.74 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  50.72 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  49.03 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 358 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  51.74 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  51.28 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 368 aa  329  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 362 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  48.4 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  328  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  48.76 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  48.76 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  49 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  47.54 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  54.23 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.93 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  325  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  48.33 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 369 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  48.61 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>