More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5301 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 367 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  72.47 
 
 		 366 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  72.47 
 
 		 366 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  70.52 
 
 		 363 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  68.96 
 
 		 364 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  67.31 
 
 		 363 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  64.03 
 
 		 369 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  64.66 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  55.25 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  57.73 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  55.8 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  53.15 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  55.22 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  53.43 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  51.39 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  51.11 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  52.14 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 359 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.31 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  46 
 
 		 352 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  47.94 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  45.09 
 
 		 539 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  46.47 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.4 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  48.84 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 350 aa  308  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  44.19 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.51 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  48.33 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  45.93 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 368 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 366 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  44.75 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 		 364 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 368 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.46 
 
 		 388 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>