More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0786 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 360 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  64.25 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  48.4 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.01 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 364 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 368 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  45.27 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 368 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  44.61 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 370 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  42.42 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.91 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.62 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.49 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.33 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 368 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 358 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 385 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.34 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  43.66 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  41.79 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.61 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  41.49 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  43.69 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>