More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5008 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 363 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  69.38 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  67.31 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  69.36 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  62.85 
 
 		 366 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  62.85 
 
 		 366 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  63.51 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  64.36 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  57.06 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  55.03 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  48.04 
 
 		 363 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  48.04 
 
 		 363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 363 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  48.72 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.79 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.98 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 359 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  48.4 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  48.89 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.55 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 539 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.6 
 
 		 368 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  48.22 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 358 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  43.26 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.88 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 		 361 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  44.79 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 385 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 365 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 369 aa  285  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>