More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0682 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  95.59 
 
 		 363 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  95.32 
 
 		 363 aa  693    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 363 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  75.14 
 
 		 363 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  55.17 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  53.5 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  52.59 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  53.5 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  52.69 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  53.43 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 372 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  50.71 
 
 		 364 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 363 aa  352  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  46.03 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 362 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 359 aa  305  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.37 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  44.96 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.79 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  45.24 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 359 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  46.38 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 368 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 368 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.86 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  45.06 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  44.55 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.1 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 365 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  43.44 
 
 		 368 aa  288  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  43.93 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 539 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  43.31 
 
 		 354 aa  285  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>