More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1555 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
364 aa  722    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  54.23 
 
 
359 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  53.96 
 
 
360 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  48.02 
 
 
366 aa  342  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 
362 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 
362 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 
362 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 
368 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  54.46 
 
 
364 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 
359 aa  329  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  54.57 
 
 
360 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  52.44 
 
 
376 aa  326  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  48.84 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  50.45 
 
 
366 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  50.87 
 
 
370 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  48.58 
 
 
368 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  50.74 
 
 
361 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 
368 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  50.44 
 
 
361 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  48.59 
 
 
366 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 
366 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  51.24 
 
 
377 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  50.73 
 
 
367 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  50.73 
 
 
367 aa  322  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 
363 aa  322  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 
356 aa  322  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  50.3 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  52.82 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  51.04 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  50.3 
 
 
362 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  48.13 
 
 
361 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 
366 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  50.3 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  48.02 
 
 
368 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  50.6 
 
 
359 aa  318  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  53.03 
 
 
359 aa  318  9e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  47.68 
 
 
368 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  50.6 
 
 
359 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  48.76 
 
 
364 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0990  3-dehydroquinate synthase  57.64 
 
 
356 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.661375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  48.76 
 
 
364 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  47.73 
 
 
368 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  49.3 
 
 
373 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  51.48 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  51.34 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 
361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  51.63 
 
 
369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  53.25 
 
 
359 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  48.3 
 
 
368 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  48.83 
 
 
358 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  50.3 
 
 
362 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 
362 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  51.19 
 
 
362 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  49.85 
 
 
362 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  48.28 
 
 
373 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  51.19 
 
 
362 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  50.44 
 
 
365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  45.69 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  50.49 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  47.81 
 
 
359 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  47.04 
 
 
354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 
372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  50.89 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
376 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 
372 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 
372 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  51.93 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  48.08 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  49.85 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  48.53 
 
 
358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  44.15 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
361 aa  305  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  44.74 
 
 
363 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>