More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3595 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  95.47 
 
 		 376 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 376 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  78.93 
 
 		 380 aa  604  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  78.86 
 
 		 381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  71.23 
 
 		 375 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  69.25 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 378 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 378 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  61.96 
 
 		 370 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  61.96 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  59.35 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  61.26 
 
 		 373 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  62.53 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  63.51 
 
 		 615 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  58.45 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  58.73 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  61.94 
 
 		 579 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  58.63 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  61.94 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  58.63 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  61.16 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  61.54 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  56.71 
 
 		 593 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  60.45 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  60.05 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  58.67 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  58.36 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  58.13 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  59.67 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  57.88 
 
 		 385 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  55.77 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  54.42 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  48.8 
 
 		 591 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.87 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  49.06 
 
 		 552 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  50.83 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.68 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  47.14 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  48.32 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 367 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  48.09 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  48.75 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.23 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  47.96 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  48.56 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  49.03 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  49.43 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  47.19 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  46.42 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  47.14 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.97 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.75 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 369 aa  281  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.02 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  46.43 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  43.6 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>