More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0910 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  88.53 
 
 		 378 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  88.53 
 
 		 378 aa  658    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 378 aa  764    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  72.88 
 
 		 375 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  69.25 
 
 		 376 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  68.45 
 
 		 376 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  70.25 
 
 		 380 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  66.67 
 
 		 381 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  58.84 
 
 		 381 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  57.59 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  59.5 
 
 		 593 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  59.31 
 
 		 371 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  61.1 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  57.59 
 
 		 382 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  60 
 
 		 615 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  58.31 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  60.38 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  57.52 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  58.31 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  61.14 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  56.71 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  57.38 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  59.14 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  58.98 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  54.97 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  56.46 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  53.93 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  53.93 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  54.2 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  54.37 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  54.74 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  52.45 
 
 		 369 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  51.47 
 
 		 591 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  48.91 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  48.38 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 552 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.95 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.49 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.49 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.67 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 		 366 aa  292  9e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.32 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  47.66 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  46.36 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  45.68 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  44 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 364 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.27 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  45.98 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.86 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  46.98 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.26 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.48 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  43.48 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>