More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1899 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 369 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  63.36 
 
 		 369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  60.82 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  56.46 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  55.77 
 
 		 376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  55.84 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  54.9 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  54.64 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  54.47 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  53.1 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  55.71 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  54.37 
 
 		 370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 594 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  56.42 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  52.69 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  54.04 
 
 		 370 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  55.06 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 370 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  52.97 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  52.43 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  54.04 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  53.72 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  54.62 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  52.03 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  54.64 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  54.64 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 		 579 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 		 579 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 		 604 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  51.49 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  52.45 
 
 		 378 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  50.71 
 
 		 591 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 593 aa  325  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  51.49 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  54.85 
 
 		 615 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  54.29 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 367 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  48.32 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 552 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  48.05 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  46.87 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  44.66 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  47.28 
 
 		 361 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  45.15 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 368 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  47.44 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>