More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02181 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  74.32 
 
 		 370 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  74.59 
 
 		 370 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  75 
 
 		 370 aa  528  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  51.28 
 
 		 361 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  47.04 
 
 		 356 aa  325  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 359 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 359 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  46.48 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 359 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  47.04 
 
 		 355 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.03 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 358 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  49.59 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  49.59 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  51.56 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  48.29 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 358 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  47.71 
 
 		 362 aa  295  9e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  46.28 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  47.75 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 368 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.39 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  48.41 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  51.2 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  49.59 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  46.93 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  44.97 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 361 aa  285  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.91 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  51.04 
 
 		 370 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  48.07 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.66 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.06 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  44.48 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.06 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 362 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 362 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 357 aa  279  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  48.46 
 
 		 362 aa  279  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  46.83 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.54 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  44.05 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.59 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>