More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2274 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 367 aa  719    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  52.47 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  52.05 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  52.16 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  54.12 
 
 		 615 aa  325  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  51.37 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  52.51 
 
 		 371 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  49.04 
 
 		 593 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  53.69 
 
 		 591 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  52.54 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  52.51 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  51.28 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  47.14 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  51.16 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  46.59 
 
 		 376 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  49.87 
 
 		 594 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  48.91 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  48.78 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  50.97 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  49.18 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  48.08 
 
 		 380 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 		 579 aa  305  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  51.78 
 
 		 579 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 370 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.05 
 
 		 604 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  50.86 
 
 		 552 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  47.97 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  47.38 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  47.53 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  47.8 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 367 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.63 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  47.38 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.09 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.51 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.22 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  46.52 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.64 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.84 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  46.4 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 369 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>