More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1950 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  88.53 
 
 		 378 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 378 aa  758    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 378 aa  758    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  74.46 
 
 		 375 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  68.35 
 
 		 376 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  69.42 
 
 		 380 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  67.49 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  60.73 
 
 		 381 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  61.05 
 
 		 382 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  60.42 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  60 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  60.53 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  59.69 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  59.69 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  60.61 
 
 		 615 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  60.33 
 
 		 594 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  61.92 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  57.65 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  59.42 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  58.38 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  61.7 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  60.65 
 
 		 604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  60.65 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  57.73 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 383 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  57.58 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  56.32 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  56.32 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  56.32 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  55.16 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  54.64 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  54.99 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  53.41 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  52.32 
 
 		 368 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  51.24 
 
 		 591 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 367 aa  328  9e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  48.62 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  47.28 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.4 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 552 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.28 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 364 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.35 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  47.9 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.03 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  44.78 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  46.53 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  48.07 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 368 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  45.2 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  44.1 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.78 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 431 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.42 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  44.99 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 364 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>