More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1800 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  64.92 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  60.82 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  56.28 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  55.07 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  58.13 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  55.22 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  54.45 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  54.92 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  54.62 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  54.47 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 383 aa  351  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  53.33 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  54.1 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  53.97 
 
 		 382 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  54.77 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  54.14 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  53.7 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 		 591 aa  335  7e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  52.76 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.17 
 
 		 594 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  52.65 
 
 		 370 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  52.65 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 383 aa  328  8e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  49.73 
 
 		 593 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  52.76 
 
 		 552 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 378 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  52.32 
 
 		 378 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  52.32 
 
 		 378 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.76 
 
 		 604 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.76 
 
 		 579 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  53.76 
 
 		 579 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  51.37 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  51.92 
 
 		 615 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  52.94 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  48.57 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  48.79 
 
 		 361 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  49.18 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  46.28 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  49.45 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  48.62 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  48.77 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  51.39 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  47.26 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  47.26 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.6 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  47.13 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  46.97 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  46.97 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  47.11 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  47.84 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.86 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  46.97 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.86 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  46.55 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  45.55 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.73 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.9 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  44.53 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  46.29 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 362 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  48.08 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  47.98 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  47.98 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  47.98 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.47 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  48.07 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>