More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1056 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 355 aa  704    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  289  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.45 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.44 
 
 		 366 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.01 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  42.21 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 358 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.45 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 367 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 376 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  43.93 
 
 		 373 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.95 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  39.44 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>