More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1241 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 361 aa  729    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  44.8 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  44.19 
 
 		 367 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 359 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 364 aa  292  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  45.12 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 358 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.28 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  44.79 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.89 
 
 		 364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.89 
 
 		 364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.87 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 369 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.97 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  44.05 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 539 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.34 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 373 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 361 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 368 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.63 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  36.91 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  44.16 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  42.24 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  43.53 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 367 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>