More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0023 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  731    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
362 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
362 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
362 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
362 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
362 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  63.08 
 
 
366 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  63.37 
 
 
361 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  62.61 
 
 
362 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 
362 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  63.37 
 
 
361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  62.32 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  63.66 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  62.5 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  63.19 
 
 
362 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  63.19 
 
 
362 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  63.19 
 
 
362 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  60.87 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  57.47 
 
 
362 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  54.18 
 
 
366 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  54.6 
 
 
366 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 
366 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  51.44 
 
 
359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  53.62 
 
 
359 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  53.64 
 
 
356 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  52.48 
 
 
359 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  51.88 
 
 
359 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  51.31 
 
 
359 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  52.33 
 
 
358 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  51.6 
 
 
359 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  51.31 
 
 
361 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 
358 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 
358 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 
358 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 
358 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 
368 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  50.72 
 
 
358 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  54.23 
 
 
368 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  51.3 
 
 
358 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  53.25 
 
 
350 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  51.03 
 
 
362 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  51.45 
 
 
358 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  51.73 
 
 
359 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  51.01 
 
 
357 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  52.79 
 
 
367 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 
365 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  52.77 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  51.6 
 
 
365 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  51.6 
 
 
376 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  51.61 
 
 
368 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  51.31 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  52.79 
 
 
367 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50.58 
 
 
374 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  51.03 
 
 
359 aa  348  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  51.6 
 
 
361 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  55.25 
 
 
367 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  51.31 
 
 
367 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
358 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 
370 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  49.27 
 
 
354 aa  338  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  50.15 
 
 
365 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  48.98 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  52.56 
 
 
388 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 
370 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  50.73 
 
 
370 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 
361 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 
361 aa  329  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  51.48 
 
 
373 aa  329  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 
368 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  49.7 
 
 
366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  47.94 
 
 
359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  48.07 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 
361 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  51.32 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  48.12 
 
 
376 aa  325  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2723  3-dehydroquinate synthase  50.87 
 
 
362 aa  325  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  52.06 
 
 
359 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 
369 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 
368 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 
360 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 
368 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  46.59 
 
 
359 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 
359 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 
359 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 
359 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  47.94 
 
 
363 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  47.97 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 
368 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 
368 aa  319  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  46.59 
 
 
368 aa  319  6e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 
368 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 
364 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.29 
 
 
358 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>