More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1218 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  742    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45.25 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 539 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.45 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.88 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 365 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.12 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  45.16 
 
 		 362 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.25 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  39.67 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  36.64 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 367 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 370 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 369 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 358 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 367 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  41.71 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.01 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  40.33 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 359 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.27 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.21 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  36.29 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 364 aa  236  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  35.64 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>