More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1050 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 377 aa  765    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  74.8 
 
 		 371 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  69.54 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  59.78 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  60.33 
 
 		 368 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  58.95 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  52.69 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  55.22 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  51.56 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  52.12 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  54.29 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  55.37 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  56.08 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  55.03 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  52.35 
 
 		 364 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  50.58 
 
 		 362 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  51.24 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  47.28 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 360 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 370 aa  293  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  45.73 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  47.72 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  43.68 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  48.55 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 358 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  46.48 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 359 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 368 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  46.51 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 364 aa  282  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.65 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  45.21 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  45.73 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.86 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 376 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  46.35 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  45.06 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.19 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.17 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  44.89 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.53 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  44.16 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  44.19 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  42.3 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.93 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.93 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 358 aa  272  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>