More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0690 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 355 aa  721    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  63.94 
 
 		 355 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  68.16 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  44.15 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  41.05 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.25 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  40.53 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  39.3 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 374 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 370 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.01 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  39.11 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  40.8 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.39 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  35.52 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  36.63 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1166  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.731457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  36.06 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  36.29 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>