More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2424 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  709    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 350 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  42.46 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  43.6 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  43.36 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  43.28 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 366 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 366 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  42.07 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 361 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 		 381 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  42.52 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  38.97 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  37.81 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  38.16 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  37.96 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>