More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1378 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 355 aa  732    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  63.94 
 
 		 355 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  58.66 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  44.27 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 367 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.38 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 374 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 364 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  38.4 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1166  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.731457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.79 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 359 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  36.71 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 363 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.27 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 361 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.01 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  35.55 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  37.53 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 360 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  36.54 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>