More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1166 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1166  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  716    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.731457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 370 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 376 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 363 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  36.52 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 385 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 362 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.72 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.28 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  34.82 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  34.83 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 615 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 552 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.52 
 
 		 593 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  35.83 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  35.49 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  35.88 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  35.01 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.01 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.22 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>