More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0474 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  745    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  72.13 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  55.99 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  56.74 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  55.9 
 
 		 361 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  55.9 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  55.34 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  56.18 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  55.9 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  55.74 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  55.34 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 361 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.75 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  48.27 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  48.27 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  47.69 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.23 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  46.82 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  45.01 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.1 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  45.01 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  48.25 
 
 		 361 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.48 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.06 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  46.44 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  46.57 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  47.56 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  43.17 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  43.17 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 376 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  46.67 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  44.65 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  45.77 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>