More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0689 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  98.86 
 
 		 350 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 350 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  44.13 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 364 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  45.24 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  43.66 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 362 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 381 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  38.98 
 
 		 615 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  38.4 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  41.71 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 376 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  38.4 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 370 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40.45 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 358 aa  242  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 361 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 378 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  39.42 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  39.48 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 593 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  39.48 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>